DTU Aqua koordinerer diplomingeniøruddannelsen Fiskeriteknologi, som uddanner fiskeriingeniører, samt kandidatuddannelsen Akvatisk Videnskab og Teknologi, som har fokus på akvakultur, fiskeri, oceanografi og forvaltning af akvatiske ressourcer.
Desuden udbyder instituttet kurser og projekter til bachelor- og kandidatstuderende på DTU og andre universiteter.
Derudover har DTU Aqua en ph.d.-skole, som løbende har omkring 40 studerende.
Læs mere om uddannelse på DTU Aqua